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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Arst8g00692 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5376 0.373 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1791
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Arst8g00692 1791 CDD B3_DNA 183 285 IPR003340 GO:0003677
Arst8g00692 1791 PANTHER UNCHARACTERIZED 718 1769 - -
Arst8g00692 1791 SUPERFAMILY P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases 1306 1500 IPR027417 -
Arst8g00692 1791 PANTHER UNCHARACTERIZED 718 1769 - -
Arst8g00692 1791 Gene3D - 1307 1487 IPR027417 -
Arst8g00692 1791 Pfam PIF1-like helicase 1310 1674 IPR010285 GO:0000723|GO:0003678|GO:0006281
Arst8g00692 1791 ProSiteProfiles B3 DNA-binding domain profile. 183 279 IPR003340 GO:0003677
Arst8g00692 1791 Gene3D - 171 281 IPR015300 -
Arst8g00692 1791 FunFam ATP-dependent DNA helicase 1704 1769 - -
Arst8g00692 1791 SUPERFAMILY DNA-binding pseudobarrel domain 182 273 IPR015300 -
Arst8g00692 1791 SUPERFAMILY P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases 1448 1790 IPR027417 -
Arst8g00692 1791 CDD SF1_C_RecD 1721 1766 - -
Arst8g00692 1791 Pfam Helitron helicase-like domain at N-terminus 672 854 IPR025476 -
Arst8g00692 1791 Pfam B3 DNA binding domain 188 270 IPR003340 GO:0003677
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Arst8g00692 Arst-Chr8 9775686 9783588 Dispersed/Transposed
       

Transcription factors information

Select Regulatory Factors Family Gene Hmm_acc Hmm_name E_value Clan
TF B3 Arst8g00692 PIF1 3.9e-138 CL0023
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Arst8g00692 - - ahf:112704978 2944.07