Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Arst7g02718 ATGAACGATTGCAGTTCCACAATGAAACCAATCAACAGTCGTTCCATCAGTGTGCAAATTCAAACCCTCCATCAACGTCTCCTTCATGCCTTGAACCTCGGAACCAGATATTTTGATGAGAAGACAAATACTTGGAAGTGGCAATGCGCTAACATTGAAGTGCAGAAGAATGTTCTTCGGTCAATTAATGCATTTCTTGATTCTATCTCAGGAGATGCACGTGCCACGCGTCATACTATTGTAAAGGAATCTGTATCTGATGTTTTGGGAGCTTTATTATGTATTCTTGAAGGCAAAAGTGGTCCCTTATTAAGCATGGCATCAAATGTTGCAGTGAAGTTAGTTAGTATTTTGCCGAATTCACTATTGCAATCTCGTATAGTGGAACTTGTCTGTTGCCTATCATCCTTAATCTCTTCGCACCAAGTAGAGGTTGCAATAGATTGTGCTAATGCCTTGAATTTGGTGGTCTCTAATTTGAGTGCTACAAGTGAGAGGACAGTTATGGAAGCCCTCAAAGACACAGCGATTGCCAGTCATATTGTTGGAAATATAAAAGACTTTGCTGGTGGTGCAAAAAAAATTGAGTATTTTGAACAGATGGGTTCACTATTGAGCACAATCCTGTGGCGGTGGCCTCAATCTAGGTTCCCTGTTTCGAGTGATGTTAAACTTATGAAAGCTTTAGCAGACATGCACATGGTGACAGATAGTTCTGTTAAACTTGTACTTTTAAAGATGTACACATCTTTAGCTTTATGCGATTTTGTAGCCAAAAAACTTATAGAAGATGGAGTATTTGTAGAGATGGTTGTGCAGGCCATGGAAAAATCAAACCCTCAGGTTGTTCGAATAGAGGGGTTTAAGCTCGCTCGATGTCTATTGAGATGCCAAGAGAATTTCATACGTATGAGGAATTTGTGTGGTGATGCACTTGTCAATGCCATAATTTGTGGGATGAGAGAAACAGGATTGAGTTCCAAAAAGGGAGGGATCAACCATGGTTCCTTATTATTGGAAGCATGTCAATTGGGTCTAATTACCCGTTGGGATGGTGATCATCATATCAGGTTTTGGGAACATGGTATTGATAGAGTCCTCCTTAATCTTGTACTAGAAAATATTCAAGATAAGTCATCTGAGCATGTCTTGTCTTTGGAAGAACAGATATCCACAGCAAACAAGAGTTTAAAATCTAATTATCATCTTGGTCTGAGGAGTTATCTGTGGGACATTCTTGGGTGCCTTATGATACATTGTGGAGAAAATTTCAACCCTTATACCTATGGAAGTGAGCTCCACATCAACACACTAATTACGTGTGCATGTCTGACTTTTGTTGACACAATTCAAAAATGGTGCCGAATATGTCAAAATGATGTTGATGATAATTTCCAAAGTGAACCAGTATCAAGGGCTGTATTAATGATGATTTATTCTCCATGTAATCACATTTCTTCACATGCAAGGCTTGTATTATCTGATAGAATGAAAGTAATAGGTATTCCGAGCTTGAAAAGCTTAATACATACTCTAGATTACACATCGTCCCTGGCAAGCTATGGGTCATCCGATAAACTTCAACTTGTTATTAACTTGATTGGGTTAAATTCTCTCTCAAGTTTACCTGAATATCAAAAATGTATCATTGAAAGCAAAGCAATGAAAGCAGTTGTTCTTATTGTCAAACGATGTTTAAGTAATGACATTCATATGGAAAGGCCTAGCATGGCTCCTCATTTGCTTACATCATTTCATGAAAGGTCATGTTGCTGCATTGATAAAGAAGATTGGGAAGGTTCCAATGTGCTCCTTTTTTATGGTTTGTGGGCCTTGTCTTCATTTGTTCATCAGTGTAGCCTTTTACAAGATCATACTCAGAAATTCACCACAGCAGTGACATACATTAAAGCTCAATTACTCAACAAGCTTCATGAGACTTGTAGTAGCACCTGTTTAAGTCCTGGAGTGAGATGGTATGCTTCATATATTCTAAGCTATTTTGGATGTTATGGTTTCCCTAATGAATTAGCAAAATGGATTGGGAAATCCCTTAATCAGGAAGAATATGCGGATTTGCGACTCATTGTGGCAAATGGGGCTTCTGTCAATGTTAATGGTGTTATTCTTGCTGTCAGATGTCCATCGCTTCTGCCTTGTGAAATCTTGACTAGTAGCAAGAATTGTGAAGAGGGAACAGATAAATATGGAGAGACTATGAGAGAGGTTCGTTTATCTGCTCATGTTGATTATGAAGCATTGGTGCTGTTGTTGGAATATGTTTACTTGGGATGCTTGCAGGCAGAGGAAGACATGGTAAAAAAGTTGAAAATTCTTGCTAAACGCTGCAATCTGCAGCCCTTTCTGCAACTACTCTATAGACAATGTCCTGAGTGGGGCACACCTTTCCCCTGCTTGAATCTTACTTCAGCTCTCAATTCTGTTGGAAGTTGTTTTTCGGATGTCATATTGGAAGCTGAAACAAATGAACTTGTTGGGTGGACATGCAATTTTTGTTCTAACTCGGTGCCACATTCGCATGTTCACAAAGTTATATTGCAGTCTGGCTGTGAATATTTACAAGGTTTATTCCGATCAGGAATGCAAGAGAGTCATTCACAAGTCATCAAGGTTGCTATTAGCTGGGAAGCATTGATCAAACTAGTACAGTGGTTTTATTCCAATAATCTGCCAAATCCTCCCGCTGGATGTTTGTGGGATAATATGGATGATGAACAAAAGCTATTCAATCTGCAACCATATGTGGAACTTAATTGGCTTGCTGAGTTTTGGATGTTGGAAAGTATTCAGGAAGCTAGTTGGAATGTGATTGTGTCTTGCCTTGATTCTGCCAGGCACTTGTCTGCTAGGATAATCAAAATGGCATACAATCTCTCTTTGTGGAAGTTGGTTGACATTGCAGCGAATTTCATGGCTCCTTCATATCGTCAATTACGAGATTCTAGTGATCTTGAAGAATTTGATGAAGCTTTAGTTCACTTAATTTATTCTGCTTCTATTCGGTTCGCACAAGAAGGTGGAAATTGCTCTAGGTGA 3057 0.3899 MNDCSSTMKPINSRSISVQIQTLHQRLLHALNLGTRYFDEKTNTWKWQCANIEVQKNVLRSINAFLDSISGDARATRHTIVKESVSDVLGALLCILEGKSGPLLSMASNVAVKLVSILPNSLLQSRIVELVCCLSSLISSHQVEVAIDCANALNLVVSNLSATSERTVMEALKDTAIASHIVGNIKDFAGGAKKIEYFEQMGSLLSTILWRWPQSRFPVSSDVKLMKALADMHMVTDSSVKLVLLKMYTSLALCDFVAKKLIEDGVFVEMVVQAMEKSNPQVVRIEGFKLARCLLRCQENFIRMRNLCGDALVNAIICGMRETGLSSKKGGINHGSLLLEACQLGLITRWDGDHHIRFWEHGIDRVLLNLVLENIQDKSSEHVLSLEEQISTANKSLKSNYHLGLRSYLWDILGCLMIHCGENFNPYTYGSELHINTLITCACLTFVDTIQKWCRICQNDVDDNFQSEPVSRAVLMMIYSPCNHISSHARLVLSDRMKVIGIPSLKSLIHTLDYTSSLASYGSSDKLQLVINLIGLNSLSSLPEYQKCIIESKAMKAVVLIVKRCLSNDIHMERPSMAPHLLTSFHERSCCCIDKEDWEGSNVLLFYGLWALSSFVHQCSLLQDHTQKFTTAVTYIKAQLLNKLHETCSSTCLSPGVRWYASYILSYFGCYGFPNELAKWIGKSLNQEEYADLRLIVANGASVNVNGVILAVRCPSLLPCEILTSSKNCEEGTDKYGETMREVRLSAHVDYEALVLLLEYVYLGCLQAEEDMVKKLKILAKRCNLQPFLQLLYRQCPEWGTPFPCLNLTSALNSVGSCFSDVILEAETNELVGWTCNFCSNSVPHSHVHKVILQSGCEYLQGLFRSGMQESHSQVIKVAISWEALIKLVQWFYSNNLPNPPAGCLWDNMDDEQKLFNLQPYVELNWLAEFWMLESIQEASWNVIVSCLDSARHLSARIIKMAYNLSLWKLVDIAANFMAPSYRQLRDSSDLEEFDEALVHLIYSASIRFAQEGGNCSR 1018
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Arst7g02718 1018 Gene3D Potassium Channel Kv1.1; Chain A 807 988 IPR011333 -
Arst7g02718 1018 SUPERFAMILY POZ domain 672 791 IPR011333 -
Arst7g02718 1018 Pfam BTB/POZ domain 846 905 IPR000210 GO:0005515
Arst7g02718 1018 SMART BTB_4 820 948 IPR000210 GO:0005515
Arst7g02718 1018 SMART BTB_4 691 800 IPR000210 GO:0005515
Arst7g02718 1018 Gene3D Potassium Channel Kv1.1; Chain A 673 796 IPR011333 -
Arst7g02718 1018 PANTHER OS06G0674800 PROTEIN 9 1013 IPR044953 -
Arst7g02718 1018 PANTHER OS06G0674800 PROTEIN 9 1013 IPR044953 -
Arst7g02718 1018 ProSiteProfiles BTB domain profile. 691 770 IPR000210 GO:0005515
Arst7g02718 1018 SUPERFAMILY POZ domain 819 944 IPR011333 -
Arst7g02718 1018 CDD BTB_POZ_ZBTB_KLHL-like 819 897 - -
Arst7g02718 1018 ProSiteProfiles BTB domain profile. 820 901 IPR000210 GO:0005515
Arst7g02718 1018 SUPERFAMILY ARM repeat 18 689 IPR016024 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Arst7g02718 Arst-Chr7 69853803 69860831 Tandem
       

Transcription factors information

Select Regulatory Factors Family Gene Hmm_acc Hmm_name E_value Clan
TR TRAF Arst7g02718 BTB 1.8e-05 CL0033
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Arst7g02718 - - mtr:25487018 1452.96