Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Apr8g1113 ATGTCGAGCCCTGAAGCTTCAATACCAGATTTGGCATGTTATACTACAACATTGGATGTTTCCAACAAAATATGGATGAGTGATAATGTCCTTGCAGCTCGTGTTCCTCTTTTGTGTATCCAAATTGCCTACAATGTTCTGTTTTCTCGTATTCTGCACCACATCTTCAAGCCCCTTCACATGCCCCTTCATGTTGCCCAGATTCTTGCTGGTTTTTTTCTGAGTGCGTCAATGTTGGGAAGATTCTCGTCTTTCTTTCATATATTGTACAGAACAGAAGGAATTCTGGCCGTTGAAACCTTTGCAAATACGGGATTGATGTACTATGTGTTCCTTAGTGGGTTGGAGATGAACTTTGAGACCATCCTAAGATCAAGCAAGAAGGCTACATGCACTGCCGTTGCTGGCATTGTGATTCCAATGCTGTTGGGGGCTGGTTTTCTTGCTATAGAACAGCAAATGCTACCAAAGGATATGATATCTGTTAAGGCTCAAGGGTACTTATTTTGGTGTTTAGTTCTTTCTGTCACAACTTTTCCGACCCTTGCTAGGCTCCTTACAGGGCTTAAGATCGTCTACACGAGGCTTGGTAAAGATGCCTTAACAGCAGCTATGTTAATTGATGCATATGGGTGGATTCTGTTTACCCTTTTGATTCCTTTTTCCAACAAAGGTGGGAAACCACTCCTCTCAGCAATGGCTACCTTGATGTTCATTGTTTTCTGCTTCTGTGTTGTGCGCCCTATCCTTAATCGCATGATCCAACACACAACAAGGATGGAGACATGGAACTACTCGAAGTTGTTGGATTTGATGGTCGGACTTCTTGTTTGCTCATACATTACAGATATGCTTGGCACACACCATGTTGTTGGGGCCTTTGTGTATGGACTAATTTTGCCTAGTGGGAAGTTTGCTGATATGACAATGGAAATGTTGGATGATTTTGTTACTGAGATTATGATCCCTGTCTACTTCTCTGGCTTTGGCTTGAGGCTTAACACTGGGATGATTTTGAGTGATCAAAATTTGTTTCTCTCTGTGCTCTTCATATTGCTGTTGGCCGTCCCAAAAGTTTTAAGCTCAATGATTGTATCTATCTTCTTTGGTATGCCTATTAGAGATGGATTGGGCATTGGATTGCTCCTCAACACCAAAGGCATCATGGCAGTGCTACTTCTAGGCGCCGCTTGGGACAAAAGTCTGATAGACCCCTTTGCCTTCACAGTGATGATGCTTGCTATAATCTTGATGACTATGTTGGTCACTCCCTTGATCAACAGTATATACAAGCCAAAATTCAGATTGATGCAATCCCAGCTAAGGACTGTGCAGAAGCAAAGGTTTGATGCAGAACTTAGAGTTGTGGCTTGTGTCCACAATGCTCGGCAAGCCATTGGCTTGATCCATGTCCTTGAAGCCGCAAATGCCACCAGAGTTTCACCCTTACATGTATCTGTGCTTCACCTTGTTGAACTCACCAGACATGGCACTGGCCTTCTTGTTGCCCGAATGGAGGGTTCAACTGCACATGGGGGATCACAAGGAACTGGACCACATTCAGAGTTTGAGAGCATAACCAAAGCATTTGATGAGTTTGTTGAGGGATACAATGCAGCTAGATATGACATATCAAATGTTGTGTCAACCTATCAAACAATCCATGAGGACATATACAATGTCACAGAAGAGAAACGTGCAAGCATAATTCTCCTTCCCTTTCACAAGCAGATAAGCTCAGAAGGTGTGCTAGAAGTAACAAACAGTGCATACAGTGACATAAACAACAATGTTCTAGAGCAACCACCTTGTTCTGTTGGCATCTTTGTGAACCGTGGTCTTGGGTCATTATTAAATACTAAAATGAGCATTATTGCGATCTTCATTGGAGGCCCTGATGACCGTGAAGCCTTGTCAATTGCATGGAGAATGGCAGGACATTCAGGAACAAAGTTGCATGCGCTGAGGCTTGTAGTGTTAGGTGAAGCTGCTGAAGAAAAAGATGAATCATTCCAGAGTGATTCTAATGGTTTGTTTTCCACAGTTATGGACAATGTGGTGCAAAAAGAGTTGGATGAAGAGTACATATTTAACTTTAGGCACAAGGGAGTGCACAATAATGAGTCCATTAGTTACTCTGAGAAGGAAGTGGTAATAGAAACTGGTGAGGAGATTCCTTTGATCCTCAATGAAGTAGACAAACCCGGGTATGACTTGTACATTATGGGACAAGGAAGTGGTAAGAACTACCTAGTTTTTAAAAAGTTGTTGGAATGGTGTGATAACCCGGAACTTGGGGTCATGGGGGATATAGTGGCTTCAACCAGTTTTGGCACACACTCTTCTTTGCTTGTTGTGCAGCAATATATGATTGGGAGACAAAGCAAGCCTAGACATCCCAGAAAATGTCACGCAAAGAAAAATGAATGTGATATGTTGTGA 2442 0.4251 MSSPEASIPDLACYTTTLDVSNKIWMSDNVLAARVPLLCIQIAYNVLFSRILHHIFKPLHMPLHVAQILAGFFLSASMLGRFSSFFHILYRTEGILAVETFANTGLMYYVFLSGLEMNFETILRSSKKATCTAVAGIVIPMLLGAGFLAIEQQMLPKDMISVKAQGYLFWCLVLSVTTFPTLARLLTGLKIVYTRLGKDALTAAMLIDAYGWILFTLLIPFSNKGGKPLLSAMATLMFIVFCFCVVRPILNRMIQHTTRMETWNYSKLLDLMVGLLVCSYITDMLGTHHVVGAFVYGLILPSGKFADMTMEMLDDFVTEIMIPVYFSGFGLRLNTGMILSDQNLFLSVLFILLLAVPKVLSSMIVSIFFGMPIRDGLGIGLLLNTKGIMAVLLLGAAWDKSLIDPFAFTVMMLAIILMTMLVTPLINSIYKPKFRLMQSQLRTVQKQRFDAELRVVACVHNARQAIGLIHVLEAANATRVSPLHVSVLHLVELTRHGTGLLVARMEGSTAHGGSQGTGPHSEFESITKAFDEFVEGYNAARYDISNVVSTYQTIHEDIYNVTEEKRASIILLPFHKQISSEGVLEVTNSAYSDINNNVLEQPPCSVGIFVNRGLGSLLNTKMSIIAIFIGGPDDREALSIAWRMAGHSGTKLHALRLVVLGEAAEEKDESFQSDSNGLFSTVMDNVVQKELDEEYIFNFRHKGVHNNESISYSEKEVVIETGEEIPLILNEVDKPGYDLYIMGQGSGKNYLVFKKLLEWCDNPELGVMGDIVASTSFGTHSSLLVVQQYMIGRQSKPRHPRKCHAKKNECDML* 814
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Apr8g1113 813 Gene3D - 37 436 IPR038770 -
Apr8g1113 813 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 46 425 IPR006153 GO:0006812|GO:0015299|GO:0016021|GO:0055085
Apr8g1113 813 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 6 799 - -
Apr8g1113 813 PANTHER CATION/H(+) ANTIPORTER 21-RELATED 6 799 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Apr8g1113 Apr-Chr8 15397219 15400785 Dispersed/Proximal
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Apr8g1113 3 807 Antiporter Super Family AT2G13620 35.844 4.48e-168 505
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Apr8g1113 - - gmx:100792990 1083.17