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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Aev07g1360 ATGGCTTCAAACTCATTTGATATGGCTTCAAACTCATTTGATAAGGTTTCTGAGGTTAATTCATCAAAACTTGGTTGGAGTTTGAAAGTGTTAGTTGTGCGTCTTTGGCAAGTTCCTTCAAGAGATGTTCCAAGCGAGGCTTACTCCATTGAGATGGTTTTGCAGGATGATAAGGGTTCAAGGATTTATGCTTATATTCCACGATCTTTAGTCAAGACAATTGGCCAGTTTGTTGTTGAGCATGATCTTTATCACATGAAAAATTTCATTGTTGGTCTTAATAACATGAAGTTTAAGACTACAACCCATAAGTTTAAGTTGACTTTTCTGATTCGAACTACAGTGACAAAGTTGGAGGATAATAACTTTCCTATGAGATTATTCAGATTCAAATCAATTGAAAAGCTTCTAGCAGATGATGAGGCAGATCAAATCACTCTTTACGATGTGTTGGGAGAAGTTGTTGCGAAGAATGATACTTCTTCTTTTGGAAGTCGTGATGGAATGGGTGATGAACTTCTTCCACACATTCAAACAACTGGTCCTGAACCAGTAATTGTGATATGCCAGTTATTTCGTGTTAAAAAGTATCAAGGTAACATTCAGATTCAGAGTAGCTATTATGCTTCAAAGTTACATGTCAATCCAGCTTGCAAGGAAGTCATTGATTTTAGGAATAAGTTGCTTTATGGAACCACAAGCTCTTCTTCAAGGATAAGTTATATTTCTTCACAAGCAAGCTATTCTGTTCATGATGAGATCCAAGTTGGAATAGTTAGTGTTAAAACTATTGATGATGTTCTCAATAGTACAGAGGAAGGAACTTACTGGGTTGTTGGTAGCATAGTTTCAATTGAAGTTGATAGTAATACTTGGAGTTATAAAGCATGTAAAAGATGTCCCAAAAAGGTTGATACTATTGGTAAACGTTTTCTCTGCAAGAAGTGCGATCATATTGAAAACACTCCATACTTGAGGTTTAGATTACAATGTATCATAGCTGATGGCACTGGAAGTTTGTCTTTGATATTGTGGGATAGGGAATCGATTCAGCTAATTGGCAAAACTGCAAATGAAATTAAGCAAGAAGCTGGTGTTGATTGTAGTCCTGTTAATAATAGTGTCACACATGATGGAGTGGGACCAATCTGGATAAAGGATTCAGTTGGTGAATCTGAGACAAGTTCAGGAAATATTACTCCAGGGAAGCGCATAGCATCAAGTACATGCAATGAATCCTCTGATGCTATTGATTTGGATACAGACTTCCAATTATCAACCACAAAGAGTGCCCGAGTCAAAGGCAATATGTTAAGACAGTCCAGAACCAAATGGATTATTGATGAAAACAGGAATATTGAGATTACTGTCAATCTTAATGAAGACACTGCTGATATCCCTTTGGATTTTATCAAACAGTTTGGGACAGAATTCAAAAATGAGGTCTACGTGATTGATAGAAATGATAATTGTTTTAAGATCAAACTTGGGTTTACAGCATATGGAAATGATGGAGAATGGATTCTTGAAGTTGAATTTGATGGTGGTGTCGATTACAGTTCTTGCAAAATTCTCAATTCAAAAGTTGGTCAACTCAAACTTGGTTGTGGTTGGAGCACTTTTAGGAAGAAATTTCATCTGAAACGTGGTTCTGTTTGCACATTTTCCATTTATGATGGACATAATAGGAGGATGAAGGTTGCATTTGAAAAAGGGAGGAGAATGCCTTTCAATTTCCCTTTTGCTATTAATAGGTATGGATGGTTCACCATTATTGGTATTGACCAAGTATGCATTTATGCCTTTGGTTATATTCCTAATACTGTGGATTATTGTGTGGTTAATCTTTTTAAGAGACGTTTCCACGATACCATGTATTGGTACACAGCTTATTCATCTGCAATGCATTGTTGGTCTGTTGCTTCACCAAGTGATAATAGGATTTATAAGTTAGGATCTAAAAGTGTTGTTTTGAGAGGAGTAGTTTATTGGATTAACTGGGTAGGTTTACATCATTGTCAGCCACATTCTGTTATATCTTTTGATTTTGGAACATTGAGATTTGATGAGATTATCATACCAGCTGATGCTAAGTCCGATTTCCAGATTTTGTGTATTAATCATGAAAAGTTATCTTATTTATCCTTTGAGAGTTGCATGTTGGATTATACTCTTATGTTGTGGCATATAGATAAAACAAATGACAAAGTATATAGCTGGACTAGAGTTGCTAGGATTTGTAATCTTGGCATTGGAGAAATTCCATCACTCTTCATTGATGAAGATTTGTTGTTTACTCAAGAGTATAATGTCAGGGAGGAAATTAGAGATGATGAAGAAGATTTAATGGGTAGAGTAATGAAATGTCTTTCATCAAAGGATGTGGTTAGTTTCAAAACAGTTAGTACAAATTGGCTTCTAAGTGTGGAGAGTGTTCAATTTGTCCGAGATCATGCTATAATTGGAGACAAGCATAGGCCATTCTTGCTGATACAATCAGATAAGTTTTCTGAAGACGATTCTATTGTTCCTAATTTCTCCCTCTTTCAGTATGATAATGCAATTCTCCAATCTCTTTCAATTCCAAACTTTTTTAATGATATGATATCTGTGGAGGTTTTCTCTTCATATCATGGTATGGTTCTTGTGAAATGTGAGTATGAGGAAAATTCAAGCATATTGTATCTATGGAATCTCTTAACTTCTGATTATAGAGAGATACTAAATTTAAAGGTGCTTCAAATCATTGATATAGTACCATCGATTGTTTATAGTCAAAAGAGGAAATGCTATGTTGTTGTTATGTTTATAACTCAGAAGATTGATGATCAGATAGTCTGCAAGTTTGGGATTATTAATGTAAAATCTCATAGTTTACCCACCTTTCAAGTTTTTTCATATGTTCCATTCGAACAACTTGAGCCTCATAGTGTGATTATTGATAATAAGGCATATATTCTTGGATTGAAGAAATTTTCCTACAACACTTTTCCAAATTGTTTGCTGAAGTTTGATATTGATGCTCATACTTTTGCTATTATAAAAGTTCCGTCATATTTGTCATTTGGTGATGCTAAAATGGTGAAGGATGATGGTAAATTGCTGCTTCTGACATGGCAACCAAGTGAAACTAATCCTTTCATGGTTTATGTATCCCTTTTGGATGACACTGATGATGATTCTGGGAAATTAAGAAGGATAGCAATTGTTGGTCCAATCCAACCAGATGAGTCACTTGTTGGTGTTTGGAAAAATAGTTTGATTTGTATCAAGGAGCAGAATACAAGTTTTGCATGGGTTGTTAGTGATGCTGATAGAATTATGTATAAATACTCTTTTGATAACAAGTTATGGGAGACAATATTTTCCCAAAAGGCTGATTTTGGAGTGCTGGATGCTTTGGACTTTAGTGATAGTTTATATTTTCCTAAAGAGTGA 3438 0.3496 MASNSFDMASNSFDKVSEVNSSKLGWSLKVLVVRLWQVPSRDVPSEAYSIEMVLQDDKGSRIYAYIPRSLVKTIGQFVVEHDLYHMKNFIVGLNNMKFKTTTHKFKLTFLIRTTVTKLEDNNFPMRLFRFKSIEKLLADDEADQITLYDVLGEVVAKNDTSSFGSRDGMGDELLPHIQTTGPEPVIVICQLFRVKKYQGNIQIQSSYYASKLHVNPACKEVIDFRNKLLYGTTSSSSRISYISSQASYSVHDEIQVGIVSVKTIDDVLNSTEEGTYWVVGSIVSIEVDSNTWSYKACKRCPKKVDTIGKRFLCKKCDHIENTPYLRFRLQCIIADGTGSLSLILWDRESIQLIGKTANEIKQEAGVDCSPVNNSVTHDGVGPIWIKDSVGESETSSGNITPGKRIASSTCNESSDAIDLDTDFQLSTTKSARVKGNMLRQSRTKWIIDENRNIEITVNLNEDTADIPLDFIKQFGTEFKNEVYVIDRNDNCFKIKLGFTAYGNDGEWILEVEFDGGVDYSSCKILNSKVGQLKLGCGWSTFRKKFHLKRGSVCTFSIYDGHNRRMKVAFEKGRRMPFNFPFAINRYGWFTIIGIDQVCIYAFGYIPNTVDYCVVNLFKRRFHDTMYWYTAYSSAMHCWSVASPSDNRIYKLGSKSVVLRGVVYWINWVGLHHCQPHSVISFDFGTLRFDEIIIPADAKSDFQILCINHEKLSYLSFESCMLDYTLMLWHIDKTNDKVYSWTRVARICNLGIGEIPSLFIDEDLLFTQEYNVREEIRDDEEDLMGRVMKCLSSKDVVSFKTVSTNWLLSVESVQFVRDHAIIGDKHRPFLLIQSDKFSEDDSIVPNFSLFQYDNAILQSLSIPNFFNDMISVEVFSSYHGMVLVKCEYEENSSILYLWNLLTSDYREILNLKVLQIIDIVPSIVYSQKRKCYVVVMFITQKIDDQIVCKFGIINVKSHSLPTFQVFSYVPFEQLEPHSVIIDNKAYILGLKKFSYNTFPNCLLKFDIDAHTFAIIKVPSYLSFGDAKMVKDDGKLLLLTWQPSETNPFMVYVSLLDDTDDDSGKLRRIAIVGPIQPDESLVGVWKNSLICIKEQNTSFAWVVSDADRIMYKYSFDNKLWETIFSQKADFGVLDALDFSDSLYFPKE* 1146
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Aev07g1360 1145 CDD RPA1_DBD_C 258 363 IPR013955 -
Aev07g1360 1145 SUPERFAMILY Nucleic acid-binding proteins 260 364 IPR012340 -
Aev07g1360 1145 CDD RPA1_DBD_A_like 27 115 - -
Aev07g1360 1145 Pfam Domain of unknown function DUF223 51 119 IPR003871 -
Aev07g1360 1145 Gene3D - 252 377 IPR012340 -
Aev07g1360 1145 Gene3D - 169 235 IPR012340 -
Aev07g1360 1145 Gene3D - 452 571 IPR015300 -
Aev07g1360 1145 Gene3D - 14 121 IPR012340 -
Aev07g1360 1145 PANTHER REPLICATION FACTOR A 1, RFA1 26 418 IPR004591 GO:0003677|GO:0005634|GO:0006260|GO:0006281|GO:0006310
Aev07g1360 1145 SUPERFAMILY Nucleic acid-binding proteins 12 120 IPR012340 -
Aev07g1360 1145 Pfam Replication factor-A C terminal domain 281 363 IPR013955 -
Aev07g1360 1145 PANTHER REPLICATION PROTEIN A 70 KDA DNA-BINDING SUBUNIT A-LIKE 26 418 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Aev07g1360 Aev-Chr7 12400631 12413800 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Aev07g1360 19 365 Core DNA Replication Machinery Family AT5G08020 23.393 1.22e-10 63.5
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Aev07g1360 - - adu:107477039 303.138