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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Aed4g0574 ATGCCCTCTACCACCATGGTTTCTCTCTCCAAACGCATGGTGTTCACCTTGTTCTTGAACACCTCGTTCCTCATGATTGTGTTTTGTGTCTCTCTTGTTGTTGTTCCCTTCAACTCTTCAGACCAACACGTTGTTCTGAGGAGCAACCGGTTCGGCTTCAGGGGTGAACAACAACAACAAGATTGCAAGAGTTTCCACAGTTTGAGGGACTCAAAAGCCAAGTGCTTGTACTTGAAAACCCATGATCCATGTGTCTCTCAGGGTTACGTTGACTACCTCTACCTTTTCTATTGCAAATTTGGGGGGTTCCCTCTATTGGGTCACACTCTTTTGTTTCTTTGGCTTTTGGTTATGTTCTATCTGTTGGCCAACACTGCCTCTGATTACTTTTGTCCTTCTCTGGAGAACTTGTCCAAATTGCTGAGGCTATCTCCCACAATTGCTGGGGTGACTCTTCTCTCTCTTGGAAACGGTGCTTGTGATGTTTTCTCCACCCTTGTCTCTTTCAAGGGTAGTGGGACCAGTGACATTGGTTTCAACACTGTTCTTGGTGGTGCTTCTTTTGTGTCATGTGTGGTGGTTGGAATAGTGAGCATTGCAGTGAGGCATAGGGGGATTCGTGTTAAGAAGCTGGCTTTGGTGAGAGATGTTTGTTTTCTCCTCTTGGTTCTTTTGTGCTTGTTAATGATTTTAATCGCCGGTGAGATCAATGTTCCTGGGGCAATTGGCTTTTGCTTGATGTATGTTGTGTATGTGGTTGTTGTTTATGTCTCATCTACCCGAGGGAACAAGGGTGTGTGTGGAGATGAAGCTGATGCTGAAATTGATGGTGATTTGAGTCATGGTGGTGGAAATGATTTATCTCTCCCTTTGCTCAGTGGAATGGAGAAAGGGCTTGTAAATGGAACTCAGGAATGTGACATGAAAATTGAGAGGAAATTTTGCTGTTTACAATCTTCAACATGTAGAAAGTTACTTTGTGTCTTGGAGATGCCACTTTACTTGCCTAGGAGGCTTACAATTCCTATTGTTTATGAAGAAAGATGGTCCAAATTTTATGCAGTTTGTTCAGCTATGCTAGCACCACTTCTATTGTTTTCCTTGTGGATCCCAAACCAGAAGGAAAACACCTTCAACTCAAACCTTATAGTTTATGGAACTGGATTGTTGGTTGGGATTATATTGGGGTTAGTTGCATTTTTCACAACCAATGTTTCAAGCCCTCCAAGGAAGTACTTGTTTCCTTGGCTTGTAGGAGGGTTTGTGATGAGTGTGACATGGAGCTACATTTCAGCTCAAGAATTGGTAGGGTTGTTGGTCTCAATTGGCTACATATGTGGAGTTAGTCCTTCAATTCTAGGCCTAACAGTTCTTGCATGGGGTAATTCAATTGGAGATTTAGTAACAAATTTGACAATGGCTTTGAATAGTGGATCAGAGGGTGCACAGATAGCAATCTCAGGTTGCTATGCTGGCCCTATCTTCAACATAGTCATTGGATTGGGCTTATCACTTGTGAGTTCTTCTTGGTGTGAGTACCCTTCATCTATTGTGATCATTAGAGACCCATATTTGTGGGAGACATTGGCACTTGTGGCACTTGGATTAATTTGGGCACTTTTTGTGCTGATTAGAAGAGACATGAAGCTTGATGCACTATTGGGGGGTGGACTTTTAGTTATTTACTTCATTTCTCTGTTGCTGAGGCTGATTCAGACACTTGGGTCTCTCCAATTTCAGGATATGTTGTTGTTAGGCTCATTCTTCAACAGTTGA 1776 0.4262 MPSTTMVSLSKRMVFTLFLNTSFLMIVFCVSLVVVPFNSSDQHVVLRSNRFGFRGEQQQQDCKSFHSLRDSKAKCLYLKTHDPCVSQGYVDYLYLFYCKFGGFPLLGHTLLFLWLLVMFYLLANTASDYFCPSLENLSKLLRLSPTIAGVTLLSLGNGACDVFSTLVSFKGSGTSDIGFNTVLGGASFVSCVVVGIVSIAVRHRGIRVKKLALVRDVCFLLLVLLCLLMILIAGEINVPGAIGFCLMYVVYVVVVYVSSTRGNKGVCGDEADAEIDGDLSHGGGNDLSLPLLSGMEKGLVNGTQECDMKIERKFCCLQSSTCRKLLCVLEMPLYLPRRLTIPIVYEERWSKFYAVCSAMLAPLLLFSLWIPNQKENTFNSNLIVYGTGLLVGIILGLVAFFTTNVSSPPRKYLFPWLVGGFVMSVTWSYISAQELVGLLVSIGYICGVSPSILGLTVLAWGNSIGDLVTNLTMALNSGSEGAQIAISGCYAGPIFNIVIGLGLSLVSSSWCEYPSSIVIIRDPYLWETLALVALGLIWALFVLIRRDMKLDALLGGGLLVIYFISLLLRLIQTLGSLQFQDMLLLGSFFNS 591
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Aed4g0574 591 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 417 569 IPR004837 GO:0016021|GO:0055085
Aed4g0574 591 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 112 256 IPR004837 GO:0016021|GO:0055085
Aed4g0574 591 PANTHER CATION CALCIUM EXCHANGER 7 578 - -
Aed4g0574 591 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 7 578 - -
Aed4g0574 591 Gene3D - 352 570 IPR044880 -
Aed4g0574 591 Gene3D - 143 268 IPR044880 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Aed4g0574 Aed-Chr4 4804294 4806069 Tandem
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Aed4g0574 18 578 Antiporters AT5G17850 51.399 1.12e-167 487
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Aed4g0574 K13754 - gmx:100787016 927.161