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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Aed1g1630 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GTTGTTGATAGTATATCTTGCTTATGGCCATAATGAAGGTGGTGCACTCTCATATATTCTTTTGAGTATAAGCAGTTGGTTTATGGCTCTATCCTGGTTGTTTGCTCCATATTTATTCAACCCGTCTGGATTTGAGTGGCAAAAGGTGGTGGAAGACTTTCGAGATTGGACAAATTGGCTACTTTACCGAGGTGGAATTGGTGTTAAGGGAGAAGAAAGCTGGGAAGCTTGGTGGGAAGAAGAACTGGCTCATATCCGGAGCTTCAGTTCAAGGATAGCAGAAACCATTCTGAGTCTTAGATTTTTCATCTTTCAATATGGTATTGTGTACAAGCTTAACGTGAAAGGAACAAGTACTTCACTGACGGTTTATGGATTCTCATGGGTAGCTCTGGCTGTGCTGATAATTCTTTTCAAGGTATTCACCTTTAGCCAGAAGATATCGGTCAATTTCCAGCTTCTTTTGCGCTTTATACAAGGACTCGCCCTTTTGGTTGCACTGGCTGGTTTAGTTGTAGCAGTTATATTGACCAACCTGTCTTTACCTGACATATTTGCTTCGATGTTGGCTTTCATTCCTACTGGATGGGGAATTCTGTCGATTGCTGCTGCCTGGAAGCCGGTGATGAAGAGGCTAGGACTATGGAAATCCGTTCGATCAATTGCTCGCCTGTATGATGCTGGTATGGGAATGCTCATCTTTGTACCCATTGCCTTCTTTTCGTGGTTCCCATTTGTATCAACATTCCAAACCCGCCTCATGTTTAACCAGGCTTTTAGCCGAGGGTTAGAAATTTCTCTAATTCTAGCTGGGAACAATCCAAATACTGGGATTTAG 5838 0.4049 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1945
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Aed1g1630 1945 Pfam 1,3-beta-glucan synthase component 1063 1762 IPR003440 GO:0000148|GO:0003843|GO:0006075|GO:0016020
Aed1g1630 1945 PANTHER BNAC03G35120D PROTEIN 30 1943 - -
Aed1g1630 1945 Gene3D - 52 171 IPR023175 -
Aed1g1630 1945 SMART FKS1_dom1_2 344 478 IPR026899 -
Aed1g1630 1945 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 30 1943 - -
Aed1g1630 1945 Pfam 1,3-beta-glucan synthase subunit FKS1, domain-1 346 475 IPR026899 -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Aed1g1630 Aed-Chr1 14352028 14388413 Wgd
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Aed1g1630 30 1945 Cell Wall Biosynthesis AT3G07160 72.294 0.0 2838
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Aed1g1630 K11000 - gmx:100787540 3388.59