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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Acco05g1367 ATGGCGCCAACATTTCTGTCTCTGTGCTTGCTCTTTTGCTTTGGCGTTGGCCTGTCCTTTTCTGGACAATCTAGCTCCATGGAATCAGTTCCCGATCTTCAGAAGTCTATGTACAAGGTAGTTGATGGATATCCTTGTGTGCGGCTACTAAATCTTTCTGGACCTATCGGTTGTTCCAATCCTGGACGAGACAAGGTTGTTGCCCCAATAGTGACATTCAAAAATGCTAATCAACTGTCAGAGTCATCTGCTATACTGGTGCAATTGGATGAGTTTGAAAGTCTCTTAACAAGAATATCTGGTGATTCAAGCTTTGCAAGTAAGGTTGCTGGTGTGCTTGTTGAGTCAGGAGCTGGAGTGCAGAATAAGTTGAAGGGATTCTCTCCAGAATTAAAGTTTCCACAAAATGAATTTGCTCCTTACCATAACACTGGATATCAATGGAACCCAACTGGTTCTGGTATCATGTGGAAATCCTACAATTTTCCTGTTTTCCTACTCTCAGATGGTAGCACGGAGACTCTTCATGAGGTTGCAACCAAGAATGAGAACAGGAAAGGTTATACAGTTAATGTGGCTGAGTTTGATCTGGTGATGCAGGTAACAAAATCTGAAAATCGTGGTTCAGAGTCTTGCTTGAAAGAAGCTACTTGCCTTCCTTTAGGTGGATACAGTGTCTGGTCATCACTTCCTCCAATCAACACTTCAGCCTTTGATCATTCTAAACCCATAATTTTGACAATGGCATCAATGGATTCTGCTTCCTTTTTTCGGGACAAGAGCCTAGGAGCAGAGTCTCCTATTTCTGGCTTGATAGCGTTGCTGGCAGCAGTTGATGCTCTCTCTCATGTGAATGGTCCTGGCGACCTTACTAAACAGCTTGCTTTTGTGGTTTTTACTGGCGAGGCATGGGGTTACCTTGGAAGTCGAAGATTTTTGCTTGAGCTTGACATGCATTCAGATGCAGTCCATGGGCTTAATAACTCACAAATTGAAACGGTTATTGAAATTGGTTCTGTTGGAAAGGGCTTCAGTGAAGGTGTTCATAGATTTTTTACTCATACATCAGGGGTAACTTCTGCTACAAATGAGACATCGGCAGCCTTGAGGCAAGCGCAAGAGTCTCTGCTATCCAAGAACATTAAGATCACATCTCCAAGTGACTCAAATCCTGGGATACCTCCGTCATCCTTTATGGCATTTTTGAAAAAGAATCCTGCAGTCTCTGGGATTGTCTTGGAAGATTTTGATGCTGTATTCACTAACAAGTTCTACCATAGTCACCTTGATGATTTATCAAATGTAAACTCATCAGCTATAGTTGCAGCTGCTTCTCTTATTGCCCGAACTCTGTACATCCTTGCTAGTGGAAAGGAAAATGTGAGAGATTCAGCTTTATCTGCTATAAATGTAAATGCGTCACTTGTTGAAGAACTTATGGGTTGCTTTTTGACCTGTGATCCTGGCCTTTCTTGTGAATTAGTGAAGAGCTATATTTCACCTTCATCAGCCTGCCCTAGCCATTATGTCGGTGTTATGGTGGATGAACCTTCATCTACACCATATCCAGAAAACATCAACGATGTTCCCAGATTTATCTGGAATTTTTTATCTGACAAAACCTCTATTTCAAAGGAAAATGGTGGCACTGGTTGTCAAGAAGATTGCAAAAGTAGGGATAAAGTTTGCATTAAAGCAGAGCCTGATGGGAAGGGGGTTTGTGTTACCTCTACAACCAGGTATGTTCCCGCATATTCAACGCGATTAAAATATGAATCAGGAGTATGGAATGTTTTGCCCCCTAATTCATCTGATGAAATGGAAGTTGTGGACCCAGTCTGGACAGAAAGCAATTGGAACACAATTGGGATTCAAGTGTACACTGTCCAAGATGCAGCTTATGATCGCCTTGTTCTGTTTGGGGGTATCACCATTACAATCTTAGCATATGTTGTAATAGAAATTACGAGAGCTTATATCACCAAAGCCTTGAAGAGGGATTGA 2004 0.4187 MAPTFLSLCLLFCFGVGLSFSGQSSSMESVPDLQKSMYKVVDGYPCVRLLNLSGPIGCSNPGRDKVVAPIVTFKNANQLSESSAILVQLDEFESLLTRISGDSSFASKVAGVLVESGAGVQNKLKGFSPELKFPQNEFAPYHNTGYQWNPTGSGIMWKSYNFPVFLLSDGSTETLHEVATKNENRKGYTVNVAEFDLVMQVTKSENRGSESCLKEATCLPLGGYSVWSSLPPINTSAFDHSKPIILTMASMDSASFFRDKSLGAESPISGLIALLAAVDALSHVNGPGDLTKQLAFVVFTGEAWGYLGSRRFLLELDMHSDAVHGLNNSQIETVIEIGSVGKGFSEGVHRFFTHTSGVTSATNETSAALRQAQESLLSKNIKITSPSDSNPGIPPSSFMAFLKKNPAVSGIVLEDFDAVFTNKFYHSHLDDLSNVNSSAIVAAASLIARTLYILASGKENVRDSALSAINVNASLVEELMGCFLTCDPGLSCELVKSYISPSSACPSHYVGVMVDEPSSTPYPENINDVPRFIWNFLSDKTSISKENGGTGCQEDCKSRDKVCIKAEPDGKGVCVTSTTRYVPAYSTRLKYESGVWNVLPPNSSDEMEVVDPVWTESNWNTIGIQVYTVQDAAYDRLVLFGGITITILAYVVIEITRAYITKALKRD 667
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Acco05g1367 667 CDD M28_Nicastrin 41 620 - -
Acco05g1367 667 FunFam Nicastrin 172 467 - -
Acco05g1367 667 Pfam Nicastrin 243 452 - -
Acco05g1367 667 SUPERFAMILY Zn-dependent exopeptidases 216 452 - -
Acco05g1367 667 Gene3D Zn peptidases 168 470 - -
Acco05g1367 667 PANTHER NICASTRIN 9 666 IPR008710 GO:0016020|GO:0016485
Acco05g1367 667 Pfam Nicastrin small lobe 45 200 IPR041084 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Acco05g1367 Acco-ChrAcco05 28888593 28907021 Dispersed