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Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vvi1g0571 ATGGGTAAGACAATTCAGGTGTATGGAGTCCCTTCTAATGTGTCTGCAAATGAAATTAAGGAATTTCTGGAAAAATATACTGGTGAAGGAACTATTGAGGCCTTAGAGATTAAGCAGCCTAAAAGTGGAGTATCAATGACACATGCTAAAGTTCAATTTACATCCTTAAGACTTGCAGAGTTAATTATCTCATTAGCTAAACAACTATGGTATGGGGGTAATTATTTGAAGGCTCGAGAAATGGATCTTGATATTATTCCAAAGCCAAGGACCTTTTTGCATAGTATGGATCGGATAACATTACATTTTGGCTATCAGATGTCAAATGAACGATTTTGTGTGCTCTGGAAAGCAATAAATGTTTCTGTCAAATTTGGGTTTGGATTGAGAAAATTTTACTTTTTTCTTTCTCATGGCTCTGAGGAGTACAAGCTTGAGCTTTCCTGTGAGAACATTTGGCAAATTCAACTACGGGAGCCACGTGGTCAAAATACAAAATTTCTCCTTATTCAGTTACTTGATGCTCCACAGATTTATGAGAAAGATGTAAGTGCTCTCAGCTATTTTAAGGAAACTCCTGATGACCAGTGGGTCAGGGAAATTGATTTTACTCCATCATGCTCTATCGGGCAATCTTCTGCATTATGTTTGGAGCTTCCACATGGCAGTCAACTACCAAATTTTTGTGAAAATTTTGCTCGTTATAAAGAAAATGACAGAAAATTCATTTTGGAGAGTGGCGCAAGTTTTTCTGGCAATTTGCATCTAGTTCCCATCGTAGGTCCACCTCAAGGATCTAACTTGCCGTTTAAAATATTGTTTAAGATTAATACTTTGGTTCAGAATGGTTGTTTATCAGGGCCTACTCTTGATACCAATTTTTTCCGGTGGGTTGATCCACAGAGAATAAATATTTCTTTTATAGAGCATGCCCTAGAAAAACTGTATTATTTGGAAGAGTGCTGTTATGAGCCTGTTAGGTGGCTCCATGAGCAGTACAGAACCTACATATCAAAGCAAGTTGCTGGATCTCCTGCTATTTCCTTGGATACTGGATTGGTGTATGTCCGGAGGGTTCAGATTACCCCATGTAAAGTATACTTTTGTGGCCCAGAGGTTAATGTCTCCAATCGGGTTTTACGCAATTATCCTGAAGATATTGATAACTTTCTCCGTGTTTCTTTTCTAGATGAGAACTCGGAGAAAATTCATTCAACAGTTATATCTCCTCGTATGTCAAATGAAGGAAGGCGAACTGGAGTATACAGAAGGATACTATCAATTCTTCAAAATGGCATAGTTATTGGTGATAAGAAGTTCGATTTTCTTGCCGTTTCTTCAAGTCAGTTGCGGGATAATTCTGCCTGGATGTTTGCTTCAAGACCTGGGCTTACTGCTGCGGACATCAGAAGCCGGATGGGTGACTTTTCTCAGATAAGAAATGTAGCAAAATATGCTGCCAGACTGGGTCAGTCTTTCAGCTCGTCCAAGGAAACATTGAAAGTTGCTAAGCATGAAATTGAAATTATTCCTGACATTGAAACCCATAGGGATGGAACAACATATGTCTTCTCTGATGGAATTGGGAAAATATCCGCTGAATTGGCTCACAGAGTGGCTATAAAATGTGGTTGTAAAAATTCTACTCCATCAGCATTCCAGATTCGATATGGTGGGTACAAGGGTGTTGTTGCTGTTGATCCAACATCATCTAGGAAATTATCATTGAGAAAGAGCATGTTCAAGTACGAATCAGAAAACACAAACCTAGATGTTTTATCATGGAGCAAATATCGGCCTTGTTTTCTCAATCGTCAATTGATCACCCTTCTATCTACTCTCGGAGTTAAGGATCATGTTTTTGAAAAGAAGCAAAGAGAAGCCGTTGATCAACTGGACACCATCTTAAAAGATCCACTAAGGGCACAGGAGGCACTGGAGTTGATGTCTCCAGGAGAGAACACTAATATTCTCAAAGAAATGCTCATGTGTGGTTATAAGCCAGATGCTGAACCATTTCTTTCAATGATGCTGCAAACTTTCCGGGCAGCAAAGTTGCTGGAACTGCGCACTAAAACAAGAATATTTGTTCCAAATGGAAGGTCTATGATGGGATGTCTAGATGAAACTAGAACCTTGGAATATGGTGAAGTGTTTGTACAGATTTCTGGCACTGGAGGAAGGCAATCCTTTGGTGATTCCCTCATGTTCTATGGAAGTGGATCACACCATGACAATTTTATTCTTGAGGGAAAGGTAGTTGTTGCTAAAAATCCTTGTCTACACCCTGGTGATGTTCGAATCCTGTCGGCTGTTGATGTGCCTGCTTTGCATCATATGGTGGATTGCGTCGTTTTTCCACAAAAAGGAATGAGACCCCACCCGGATGAATGTTCGGGGAGTGATTTGGATGGAGATATCTACTTTGTTTGTTGGGATCATGATCTAATTCCACCTCGACAAATCAATCCCATGGATTATACCCCAGCGCCAACTAAGGTCTTGGATCATGATGTCATGATTGAGGAAGTTGAGGAGTATTTCACCAACTACATAGGGAATGACAAGTTAGGAATCATTGCAAATGCCCACACCGTCTTCGCAGATAAGGAGTACGACAAAGCATTGTGTCCTCCTTGCAAAGAGCTTGCAAAGTTGTTTTCAATTGCTCTAGAGTTCCCCAAAACTGGTGTGCCTGCTGAAATACCATTTCATCTACATGTGAAGGAATATCCAGATTTCATGGAAAAGGCCAACAAACCAACCTATGAATCACAATCTGTGATTGGAAAGCTTTTTCGAGAAGTGAAAGACGTTGCACCACACAACTATGATGTAAGATCCTTCACCAGGGATGTGGCAATGCAGTCTTATGACGCTGACATGGAAGTGGATGGTTTTGAAGACTATGTCAGAGATGCTTTCTACTACAAAAGTCAATATGATTTTAAGTTGGGGAGCCTGATGGATTGCTGTGGCATTAGAACAGAGAGTGAAATACTCAGTGGGAGTATCATGAAAATGTCAAAATCTTTTGATAAGAGGAAGGATGCAGAAGCCATTGCTTTGGCTGTAAGATCCTTGAGAAAGGAAGCTAGGACATGGTTCAACAAGATGGGAAGTGGGACATATGCTGGAGCTGATGATGTATACGCAATAGCATCTGCATGGTACCATGTTACTTATCATCCTTATTATTGGGGTTGCTACAATGAGGGAATGTATCATGACCATTTCCTCAGTTTTCCATGGTGTGTTTATGACAAACTGATTCAGATCAAGAGGGATAAAATGAGTATTAGGTCTCTACATCTGTCATTGCTGGGATGA 3330 0.4018 MGKTIQVYGVPSNVSANEIKEFLEKYTGEGTIEALEIKQPKSGVSMTHAKVQFTSLRLAELIISLAKQLWYGGNYLKAREMDLDIIPKPRTFLHSMDRITLHFGYQMSNERFCVLWKAINVSVKFGFGLRKFYFFLSHGSEEYKLELSCENIWQIQLREPRGQNTKFLLIQLLDAPQIYEKDVSALSYFKETPDDQWVREIDFTPSCSIGQSSALCLELPHGSQLPNFCENFARYKENDRKFILESGASFSGNLHLVPIVGPPQGSNLPFKILFKINTLVQNGCLSGPTLDTNFFRWVDPQRINISFIEHALEKLYYLEECCYEPVRWLHEQYRTYISKQVAGSPAISLDTGLVYVRRVQITPCKVYFCGPEVNVSNRVLRNYPEDIDNFLRVSFLDENSEKIHSTVISPRMSNEGRRTGVYRRILSILQNGIVIGDKKFDFLAVSSSQLRDNSAWMFASRPGLTAADIRSRMGDFSQIRNVAKYAARLGQSFSSSKETLKVAKHEIEIIPDIETHRDGTTYVFSDGIGKISAELAHRVAIKCGCKNSTPSAFQIRYGGYKGVVAVDPTSSRKLSLRKSMFKYESENTNLDVLSWSKYRPCFLNRQLITLLSTLGVKDHVFEKKQREAVDQLDTILKDPLRAQEALELMSPGENTNILKEMLMCGYKPDAEPFLSMMLQTFRAAKLLELRTKTRIFVPNGRSMMGCLDETRTLEYGEVFVQISGTGGRQSFGDSLMFYGSGSHHDNFILEGKVVVAKNPCLHPGDVRILSAVDVPALHHMVDCVVFPQKGMRPHPDECSGSDLDGDIYFVCWDHDLIPPRQINPMDYTPAPTKVLDHDVMIEEVEEYFTNYIGNDKLGIIANAHTVFADKEYDKALCPPCKELAKLFSIALEFPKTGVPAEIPFHLHVKEYPDFMEKANKPTYESQSVIGKLFREVKDVAPHNYDVRSFTRDVAMQSYDADMEVDGFEDYVRDAFYYKSQYDFKLGSLMDCCGIRTESEILSGSIMKMSKSFDKRKDAEAIALAVRSLRKEARTWFNKMGSGTYAGADDVYAIASAWYHVTYHPYYWGCYNEGMYHDHFLSFPWCVYDKLIQIKRDKMSIRSLHLSLLG* 1110
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vvi1g0571 1109 SUPERFAMILY RNA-binding domain, RBD 2 82 IPR035979 GO:0003676
Vvi1g0571 1109 PANTHER RNA-DEPENDENT RNA POLYMERASE 3 1098 IPR007855 GO:0003968
Vvi1g0571 1109 Pfam RNA dependent RNA polymerase 361 936 IPR007855 GO:0003968
Vvi1g0571 1109 CDD RRM_SF 5 79 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vvi1g0571 Vvi-Chr1 5627438 5633436 Tandem