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Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Tsu01g01142 ATGgttaaaagtaaaacaattgaGTTGTACGGATTCCCTTCTTCTGTGAACGTTTCTGATGTAAAGAGATTTGTAGAGAAGCTTACCGGTGAAGGAAGTGTGGTTGCTATGAAGATTAGAGTCGGTAAAGGCCGGATTCCAAGAGCATTTGCAATTATTCAATTCACTACCGCAAGACATGCTACTTTCATGATTGCCTTACCAATCAGAAGTGCGTCAACATTGCGGTATGGTAGCTCCTATTTAAAAGTTCGGGAAATGGAAAGAGATATTGATCCAAATCCAAGGGTATTTTTGGACAGTTTGGATGATGTGAAACTGTATTTTGGCTGTCTGATATCAAAGGAAAGATTCTCCGTATTATGGAGCAAGGCGGATGTTTGTGTAGATTTTGGGATTGGGATGAAAAAGTGGCGATTCTCTTTGCACCATGACGATAAGAAGTTCAAACTTGAGCTTTCATATGAGAATATTTGGAAGATTGAGCTGCATCAACCACAGGGTAAAACTGCAAAGTATCTATTGATTCAGTTATTAGGTGCTCCTCGGGTTTATGAGCTTTATGTTCCTAATTCAGATGTTGGTGTATACAGCATATACAACGATCCTTTGATGAACTATAATAAAGATTCCCCTGATGACCAATGGATCCGTGCAATAGATTTCACTCCTTGCAGTTGTATTGGGCAGTCTTCTGCTATATGTGTAGAGCTTCCTAGTAACAGAGATTTTCCGAATTTCCGGGCAAACTGTGCTCACTATGAGGAAAGTGAGGGTCAATTCACATTGCAGAGCGGATTAGCTTTTTCTTCTAATCCGGATGTTGTCCCCATGGTTGCTCCTCCTAGAGGATTTCAAATTCCATTTGACATCTCTTTTAAAGTTAATTCATTGGTTCAGCACGGGTGTGTTTCAGGTTCGGAACTCGATAATGATTTCTATCGTCTAGTTGATCCACATAGAATAAACGTCGATTTTATCGAGCATGCTTTAGAGAAGATGTACTATTCAAAGGATTTCTGTTATGAACCGGCAAGATGGCTGAAAGATCAATACAGAAGGTACCTTGGTGCAAATACTCCGCCTCGGTCACCTACTATATCTTTGGATAACGGGTTGGTATATATTCGCAGGGCTCAGATAACACCATGCAAAGTATACTTTTGTGGTCCAGAGATTAATGTCTCGAATCGTGTTCTCCGTCATTTCCATGAGCATATCGATAACTTTCTGCGTGTTTCATTTGTTGACGAGGAGTTGGATAATCTGTATTCAGCAGATTTATCTACACGTATTTCTGAGCGTGGGAAAACTGGGATATACTATAGAATTCTTTCCATCCTTATGAATGGCTTAGATATTGCTGGTAAGAAGTTTGAATTTCTAGCTTTCTCATCAAGTCAGCTGCGTGAAAATTCCCTATGGATGTTTGCTCGTACAACAACTGGACTTACTGCCGATTCCATAAGGGCATGGATGGGAGATTTTAGCCGGATAAGAAATGTGGCTAAATATGCTGCTAGACTTGGACAATCTTTTGGTTCGTCTACTGAAACTCTAAGTGTCAGCAGggatgaaattgaaattattcCCGACGCGAAGGTTAAACATGGTGCAACCGAATATGTCTTCTCTGATGGAATTGGGAAAATATCTCTTGAACTTGCACGTAAGGTGGCTAAAAAATGTGGTTATGATATAATTCCGTCCGCGTTTCAGATTCGATATGGCGGGTACAAAGGAGTTGTGGCTGTTGATCCAACCTCGTTTGTGAAGCTGTCACTGAGGAAGAGTATGCACAAGTATGAGTCAGATAACACAAAATTGGATGTTTTGGCATGTAGTAAGTTTCAGCCTTGTTATCTGAATCGGCAGTTGATTACTCTCTTATCCACACTCGGTGTCAAGGACGGTGTCTTCGAGAAAAAACAGAAAGAAGCTGTTGATCAACTGAACACAATACTAACAGATTCGACGAAGGCACAGGAGGTTTTGGACTTGATGTCTTCCGGAGAGGTCACTAATATTCTGAAAGAGATGCTTATTTGTGGCTACAAGCCTAATGTGGAACCATTTCTTTCGATGATGCTGCAGACATTTAGGGCATCAAAACTGTTGGAATTGCGACAAAAAACTAGGATATTTATTCCAAAAGGCAGAGCAATGATGGGAGTTCTTGATGAAACAAGAACCCTAGAATATGGTGAAGTTTTTGTTCAATATTCGAACAATAGGTTCAGCAATCGTTCTCATGTAGTTATTGGTAAGGTGGTAGTAGCAAAAAACCCATGCTTGTACCCAGGCGATGTGCGTGTTTTAAAGGCTGTGGATGTGCCAGCTTTGCGTCACATGGTGGATTGTGTTGTTTTCCCCCAACAAGGTCGCAGGCCGCATCCAAATGAATGTTCGGGAAGTGATCTAGACGGGGACATCTACTTTGTTTGTTGGGATTCTGAATTGGTTCCACCTAGAACAATTGATCCGATGGAGTATGATACTGCCCAACCTATTGTATTGGATCATGATGTCGAGATTGAGGAGGTGGAGGAGTATTTTACCAATTACATACTCAATGACAGTCTTGGAATAATTGCCAATGCACACACTGTCTTTGCAGATAAAGAACCTCTTAAAGCAATGGCTGAGCCATGTATTGAGCTTGCGAAGCTATTCTCAACAGCAGTCGATTTTCCAAAAACTGGTATCCCAGCCGTTATACCTCGTGAACTTTTCGCTAAAGAATATCCTGATTTCATGGAGAAGTCTGACAAAGCAACATACAAGTCAAATAATGTAATAGGAACACTTTTTAGGGAAATTCAAGGGATTTCGACAAGGGATGGCTCCATTACATCTTTCACATGTGAAGTGGCTAAAAGTTCGTATGATACTGACATGGAAATGGATGGCTTTATGGATTATGTTGATGATGCATTCTATCACAAATCCAATTATGACTACAAGTTGGGAAATCTGATGGACTACTATGGTATCAAAACTGAATCAGAAATCCTCAGTGGGAACATTATGAAAATGTCAAAATCTTTCACCAAAAGAAGGGATGCTGATGCGATTACTATGGCTGTAAGGTCCTTAAGGAAAGAGGCTAGGAGTTGGTTCAATGAGGGCGGTACTGGTGTAGATTCTGGAAGTGATGATGCATATGCAAAAGCTTCTGCTTGGTACTATGTTACTTACCATCATAGTTACTATGGTTTGTACAATGAAGGTATGAATAGGGACCATTTTCTAAGCTTTCCATGGTGTGTTTACCATTTGCTTGTACAAATCAAGAAGGAGAAAGTAAGGATAAGGATGCATGCTAGCATGGAACAAAGTTTCAGTCTTCGGTTGCATCTTGATTGA 3366 0.4011 MVKSKTIELYGFPSSVNVSDVKRFVEKLTGEGSVVAMKIRVGKGRIPRAFAIIQFTTARHATFMIALPIRSASTLRYGSSYLKVREMERDIDPNPRVFLDSLDDVKLYFGCLISKERFSVLWSKADVCVDFGIGMKKWRFSLHHDDKKFKLELSYENIWKIELHQPQGKTAKYLLIQLLGAPRVYELYVPNSDVGVYSIYNDPLMNYNKDSPDDQWIRAIDFTPCSCIGQSSAICVELPSNRDFPNFRANCAHYEESEGQFTLQSGLAFSSNPDVVPMVAPPRGFQIPFDISFKVNSLVQHGCVSGSELDNDFYRLVDPHRINVDFIEHALEKMYYSKDFCYEPARWLKDQYRRYLGANTPPRSPTISLDNGLVYIRRAQITPCKVYFCGPEINVSNRVLRHFHEHIDNFLRVSFVDEELDNLYSADLSTRISERGKTGIYYRILSILMNGLDIAGKKFEFLAFSSSQLRENSLWMFARTTTGLTADSIRAWMGDFSRIRNVAKYAARLGQSFGSSTETLSVSRDEIEIIPDAKVKHGATEYVFSDGIGKISLELARKVAKKCGYDIIPSAFQIRYGGYKGVVAVDPTSFVKLSLRKSMHKYESDNTKLDVLACSKFQPCYLNRQLITLLSTLGVKDGVFEKKQKEAVDQLNTILTDSTKAQEVLDLMSSGEVTNILKEMLICGYKPNVEPFLSMMLQTFRASKLLELRQKTRIFIPKGRAMMGVLDETRTLEYGEVFVQYSNNRFSNRSHVVIGKVVVAKNPCLYPGDVRVLKAVDVPALRHMVDCVVFPQQGRRPHPNECSGSDLDGDIYFVCWDSELVPPRTIDPMEYDTAQPIVLDHDVEIEEVEEYFTNYILNDSLGIIANAHTVFADKEPLKAMAEPCIELAKLFSTAVDFPKTGIPAVIPRELFAKEYPDFMEKSDKATYKSNNVIGTLFREIQGISTRDGSITSFTCEVAKSSYDTDMEMDGFMDYVDDAFYHKSNYDYKLGNLMDYYGIKTESEILSGNIMKMSKSFTKRRDADAITMAVRSLRKEARSWFNEGGTGVDSGSDDAYAKASAWYYVTYHHSYYGLYNEGMNRDHFLSFPWCVYHLLVQIKKEKVRIRMHASMEQSFSLRLHLD 1121
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Tsu01g01142 1121 Pfam RNA dependent RNA polymerase 381 940 IPR007855 GO:0003968
Tsu01g01142 1121 PANTHER RNA-DEPENDENT RNA POLYMERASE 4 1115 - -
Tsu01g01142 1121 PANTHER RNA-DEPENDENT RNA POLYMERASE 4 1115 IPR007855 GO:0003968
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Tsu01g01142 Tsu-Chr1 10564450 10570945 Tandem
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Tsu01g01142 01 10564450 10570945 Tsu01g01142 01 10564450 10570945 ECH