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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Tpr1g2959 ATGGTTAAAAGTAAAACAATTGAGTTGTATGGATTCCCGTCTTCAGTGAACGTTTCTGATGTAAAGAGATATGTAGAGAAGCTTACTGGTGAAGGAAGTGTGGTTGCTATGAAGATTAGAGTTGGTAAAGGCCGGATTCCAAGAGCATTTGCAATTATTCAATTCACTACTGCAAGACATGCTACATTCATGATTGCCTTACCTATCAGAAGTTCATCAACATTGCGGTATGGGAGCTCCTATTTAAAAGTTCGGGAAATGGAAAGAGATATTGATCCAAATCCAAGGGTATTTCTGGACAGTTTGGATGATGTGAAGCTGTATTTTGGTTGTCAAATATCAAAGGAAAGATTCTCTGTATTATGGAGCAAGGCGGATGTTAGTGTAGATTTTGGGATTGGGATGAAAAAGTGGCGATTCTCTATGCTCCATGACGATAAGAAGTTCAAACTTGAGCTTTCATATGAGAATATTTGGAAGGTTGAGCTGCATCAACCACAGGGTAAAACTGCAAAGTATCTATTGATTCAGTTACTAGGTGCTCCTCGGGTTTATGAGCTTAATATTCCTAATTCAGATGTTGATGTATATAACATATACAATGATCCTTTGAAGAACTATAATAAGGATTCCCCTGATGACCAATGGATTCGTGCAATAGATTTCACTCCTTGCAGTTGTATTGGGCAGTCTTCTTCTATATGTGTAGAGCTTCCTAGTAACAGAGATTTTCCAAATTTTCGGGAAAACTGTGCTCATTATGAGGAAAGTGAGGGTCAATACACATTGCAGATCGGATCACCTTTTTCTTCCAATCCGGATGTTGTCCCTATGGTTGCTCCTCCTCAAGGAATTCGAATTCCATTTGACATCCTGTTTAAGGTCAATTCATTGGTTCAGCACGGGTGTGTTTCAGGTTCTGAACTCGATAATCATTTCTATCGTCTAGTGGATCCACTTAGAATAAACGTCGATTTTATCGAGCATGCCTTAGAGAAGATGTACTATGCAAAGGATTTCTGTTATGAACCAGTAAAATGGCTGAAAGATCAATACAGAATGTACCTTGGTGCAAAAGCTCCACCCCGCTCACCTACTATATCTTTGGATAATGGGTTGGTATACATTCGCAGGGCTCAGATAACACCATGCAAAGTATACTTTTGTGGTCCAGAGATTAATGTCTCGAATCGTGTTCTCCGTAATTTCCATGAACATATCGATAACTTTCTGCGTGTTTCATTTGTTGACGAGGAGTTGGATAATCTGTATTCAGCAGATTTATCTACACGTAATTCTGAGCGTGGGAGAACTGGGATATACTATAGAATTCTTTCCATCCTTATGAATGGCTTAGATATTGGTGGTAAGAAGTTCGAATTTCTAGCTTTCTCATCAAGTCAGTTGCGTGAAAATTCCCTATGGATGTTTGCTCGTACAACAACTGGAGTTACTGCAGATTTCATAAGGGCATGGATGGGAGATTTTAGCCGGATACGAAATGTGGCTAAATATGCTGCTAGACTCGGACAATCTTTTGGTTCGTCTACCGAAACTCTAAGTGTCAGCAGGGACGAAATTGAAATTATTCCTGACGCGAAGGTTAAACACGGTGCAACCGAATATGTCTTCTCTGATGGAATTGGGAAAATATCTCTTGAACTTGCACGGAAGGTGGCTAAAAAATGTGGGTATGATTCAATTCCATCCGCGTTTCAGATTCGATATGGCGGGTACAAAGGAGTTGTGGCTGTTGATCCAACCTCGTCTGTGAAGCTGTCACTGAGGAAGAGTATGCACAAGTATGAATCAGATAACATAAAATTGGATGTTTTGGCATGTAGTAAGGTTCAACCTTGTTATCTGAATCGGCAGTTGATCACTCTCTTATCCACTCTCGGTGTCAAGGACGGTGTTTTCGAGAAAAAACAGAAAGAAGCTGTTGATCAACTGAACACAATACTAACAGATTCGACGAAGGCACAGGAGGTTTTGGACTTGATGTCTTCCGGAGAGGTCACTAATATTCTGAAGGAGATGCTTATTTGTGGTTACAAGCCTAATGTTGAACCATTTCTTTCGATGATGCTGCAGACATTTAGGGCATCAAAACTTTTGGAATTGCGACAAAAAACTAGGATATTTATTCCAAGAGGAAGAGCTATGATGGGAGTTCTAGATGAAACAAGAACCCTAGAATATGGTGAAGTATTTGTTAAATATTCTAACAATAGGTTCGGCAATCGTTCTCATGTAGTTATTGGTAAGGTAGTCGTAGCAAAAAACCCCTGCTTGTACCCAGGCGATGTGCGTGTTTTAAACGCTGTGGATGTGCCAGCTTTGCGTCACATGGTGGATTGTGTTGTTTTTCCTCAAAAAGGTCGCAGGCCCCATCCAAATGAATGTTCTGGAAGCGATCTAGACGGGGACATCTACTTTGTTTGTTGGGATTCTGAATTGGTTCCACCTAGAACAATTGATCCAATGGAGTATGATACTGCACAACCTATTGTATTGGATCATGATGTGGAGATTGAGGAGGTGGAGGAGTATTTTACCAATTACATACTCAATGACAGTCTTGGAATAATTGCCAATGCACACACTGTCCATGCAGATAAAGAACCTCTTAAAGCAATGGCTGAGCCATGTATTAAGCTTGCGAAGCTATTCTCAACAGCAGTCGACTTTCCAAAAACTGGTATCCCAGCTGTTATACCTCGTGAACTTTTCGCCAAAGAATATCCTGATTTCATGGAGAAGTCTGACAAAACAACATACAAGTCGAATAATGTAATAGGAACACTTTTTAGGGAAATTCAAGAGATTTCGACAAGGGACGGCTCCATTACATCCTTCACACGCGAAGTGGCTAAAAATTCGTATGATCTTGACATGGAAATGGATGGCTTTATGGATTATGTCGACGATGCCTTTTATCACAAAAGCAATTATGACTACAAGTTGGGAAATCTGATGGACTACTATGGTATCAAAACCGAATCAGAAATCCTTAGTGGCAATATTATGAAAATGTCAAAATCTTTCACCAAAAGAAGGGATGCGGATGCGATTACTATGGCTGTAAGGTCCTTAAGGAAAGAGGCGAGGAGTTGGTTCAATGAAGGCGGCACCAGTGTAGATTCTGGAAGTGATGATGCATATGCAAAAGCTTCTGCTTGGTACTATGTTACTTACCATCACAGTTTCTATGGTTTGTACAATGAAGGTATGAATAGGGACCATTTTCTAAGCTTTCCATGGTGTGTTTACCATTTGCTTGTGCAAATCAAGAAGGAAAAAGTAAGGATGAGGATGCATGCTAGCATGGAACAAAGTTTCAGTCGTCGGTTGCGTCTTGATTGA 3366 0.4023 MVKSKTIELYGFPSSVNVSDVKRYVEKLTGEGSVVAMKIRVGKGRIPRAFAIIQFTTARHATFMIALPIRSSSTLRYGSSYLKVREMERDIDPNPRVFLDSLDDVKLYFGCQISKERFSVLWSKADVSVDFGIGMKKWRFSMLHDDKKFKLELSYENIWKVELHQPQGKTAKYLLIQLLGAPRVYELNIPNSDVDVYNIYNDPLKNYNKDSPDDQWIRAIDFTPCSCIGQSSSICVELPSNRDFPNFRENCAHYEESEGQYTLQIGSPFSSNPDVVPMVAPPQGIRIPFDILFKVNSLVQHGCVSGSELDNHFYRLVDPLRINVDFIEHALEKMYYAKDFCYEPVKWLKDQYRMYLGAKAPPRSPTISLDNGLVYIRRAQITPCKVYFCGPEINVSNRVLRNFHEHIDNFLRVSFVDEELDNLYSADLSTRNSERGRTGIYYRILSILMNGLDIGGKKFEFLAFSSSQLRENSLWMFARTTTGVTADFIRAWMGDFSRIRNVAKYAARLGQSFGSSTETLSVSRDEIEIIPDAKVKHGATEYVFSDGIGKISLELARKVAKKCGYDSIPSAFQIRYGGYKGVVAVDPTSSVKLSLRKSMHKYESDNIKLDVLACSKVQPCYLNRQLITLLSTLGVKDGVFEKKQKEAVDQLNTILTDSTKAQEVLDLMSSGEVTNILKEMLICGYKPNVEPFLSMMLQTFRASKLLELRQKTRIFIPRGRAMMGVLDETRTLEYGEVFVKYSNNRFGNRSHVVIGKVVVAKNPCLYPGDVRVLNAVDVPALRHMVDCVVFPQKGRRPHPNECSGSDLDGDIYFVCWDSELVPPRTIDPMEYDTAQPIVLDHDVEIEEVEEYFTNYILNDSLGIIANAHTVHADKEPLKAMAEPCIKLAKLFSTAVDFPKTGIPAVIPRELFAKEYPDFMEKSDKTTYKSNNVIGTLFREIQEISTRDGSITSFTREVAKNSYDLDMEMDGFMDYVDDAFYHKSNYDYKLGNLMDYYGIKTESEILSGNIMKMSKSFTKRRDADAITMAVRSLRKEARSWFNEGGTSVDSGSDDAYAKASAWYYVTYHHSFYGLYNEGMNRDHFLSFPWCVYHLLVQIKKEKVRMRMHASMEQSFSRRLRLD* 1122
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Tpr1g2959 1121 PANTHER RNA-DEPENDENT RNA POLYMERASE 4 1115 - -
Tpr1g2959 1121 Pfam RNA dependent RNA polymerase 381 940 IPR007855 GO:0003968
Tpr1g2959 1121 PANTHER RNA-DEPENDENT RNA POLYMERASE 4 1115 IPR007855 GO:0003968
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Tpr1g2959 Tpr-Chr1 33954383 33960953 Tandem
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Tpr1g2959 1 33954383 33960953 Tpr1g2959 1 33954383 33960953 ECH